На данный момент общей канализационной системы в городе нет, только отдельные резервуары в разных частях города. По словам главы Нефтеюганска Сергея Дегтярева, именно поэтому возникают проблемы с отведением дождевых и талых вод. Чтобы исправить ситуацию, город условно разделили на четыре части. Для каждого участка будет разработан свой проект ливневой канализации, которые впоследствии будут подключены к магистральному водоводу. В 2021 году начнется проектирование для 12,13 и 14 микрорайонов.
